ATCC 25922 Escherichia Coli (Migula) Castellani ve Chalmers

Mikrobiyoloji dünyasında, Escherichia coli ATCC 25922 gibi altın standart statüsüne ulaşan çok az bakteri türü vardır. Amerikan Tip Kültür Koleksiyonu (ATCC) tarafından korunan ve dağıtılan bu Gram negatif çubuk, dünya çapındaki laboratuvarlarda kalite kontrolü için bir temel taşı görevi görmektedir. İlk olarak 1946 yılında bir insan klinik örneğinden izole edilen ATCC 25922, mütevazı kökenlerini aşarak antimikrobiyal duyarlılık testi, araştırma ve tanı doğrulamasında vazgeçilmez bir araç haline gelmiştir. Güvenilirliği, iyi karakterize edilmiş genomu ve öngörülebilir davranışı, onu antibiyotiklerin, besiyerlerinin ve test protokollerinin doğruluğunu sağlamak için başvurulacak bir referans haline getirmektedir.

ATCC 25922, ilk olarak 1946 yılında ABD Gıda ve İlaç Dairesi (FDA) tarafından klinik bir örnekten izole edilmesiyle başlar. Başlangıçta farklı isimler altında kataloglanan bu suş, ATCC koleksiyonuna 25922 suş numarasıyla kaydedilmiştir. On yıllar boyunca, küresel veri havuzlarında paylaşılmış ve farklı adlarla anılmıştır. 20. yüzyılın sonlarına doğru, ATCC 25922’nin standardizasyon çalışmalarındaki faydası onu öne çıkarmıştır. Antibiyotik direnci küresel bir krize dönüştükçe, tutarlı referans suşlara duyulan ihtiyaç büyük önem kazanmış ve bu alandaki büyük kuruluşlar, minimum inhibitör konsantrasyon testi için bir ölçüt olarak bu suşu onaylayarak, klinik mikrobiyolojideki rolünü pekiştirmişlerdir.

Escherichia coli ATCC 25922, patojenik olmayan Escherichia coli suşlarının tipik özelliklerini örneklemektedir: hareketli, fakültatif bir anaerob olup laktozu fermente eder, 37 derecede optimum şekilde büyür ve MacConkey agarında karakteristik pembe koloniler oluşturur. Ancak onu diğerlerinden ayıran şey fenotipik stabilitesidir. Ancak araştırmacılar, et suyunda tekrarlanan pasajların minimum inhibitör konsantrasyon seviyelerini değiştirebileceğini belirterek, tutarlılık için agar bakımı ve stokun hemen dondurulmasını önermektedir.

Genetik olarak, suşun tüm genomu 2014 yılında dizilenmiş ve birleştirilmiştir. Genomun erişilebilirliği, metabolik yolları, virülans faktörleri (veya bunların eksikliği) ve evrimsel adaptasyonları üzerine yapılan çalışmaları desteklemiştir.

ATCC 25922’nin başlıca ünü antimikrobiyal duyarlılık testinde yatmaktadır. Penisilinler, sefalosporinler, aminoglikozitler ve florokinolonlar dahil olmak üzere bir dizi antibiyotik için önerilen kalite kontrol organizmasıdır. Laboratuvarlar, disk difüzyon ve et suyu seyreltme yöntemlerini doğrulamak ve sonuçların sınır değerleriyle uyumlu olmasını sağlamak için bu yöntemi kullanır.

ATCC 25922, antimikrobiyal duyarlılık testin yanı sıra, ortam performans testleri, boya doğrulama ve tanımlama kiti değerlendirmelerinde de öne çıkar. Saflaştırılmış genomik DNA’sı, PCR testlerinden yeni nesil dizilemeye kadar moleküler biyolojiyi destekler. Araştırmalarda, bakteriyel stres tepkilerini incelemek için bir modeldir.

ATCC 25922, bağırsaklarda zararsızca kolonileşen ancak düzensizleştiğinde risk oluşturan bir bakteri olan Escherichia coli paradoksunu somutlaştırıyor. Bir referans suşu olarak, mikrobiyolojiyi demokratikleştiriyor ve çeşitli laboratuvarların artan antimikrobiyal dirence karşı uygulamaları standartlaştırmasını sağlıyor. Genom dizisi, karşılaştırmalı genomik çalışmalarına ivme kazandırarak laboratuvarda adapte edilen suşların vahşi tiplerden nasıl farklılaştığını ortaya koyuyor.

Geleceğe bakıldığında, sentetik biyoloji sayesinde ATCC 25922, aşı geliştirme veya biyoremediasyon için tasarlanmış varyantlara dönüşebilir. Ancak, kalıcı değeri basitliğinde yatıyor, dondurulmuş bir şişe, güvenilir bilimin tutarlı bir temelle başladığını hatırlatıyor. Mikrobiyal belirsizlik çağında, bu 78 yıllık suş, tekrarlanabilirliğin bir simgesi olmaya devam etmektedir.

ATCC 25922 (Escherichia coli), şu temel nedenlerden dolayı klinik mikrobiyoloji ve laboratuvar kalite kontrolünde en önemli bakteri suşlarından biridir:

• Antimikrobiyal duyarlılık testi için küresel altın standarttır: Dünya çağında ilgili kuruluşlar tarafından neredeyse tüm disk difüzyon ve minimum inhibitör konsantrasyonu test yöntemleri için önerilen resmi kalite kontrol suşudur. Her gün, dünya çapında binlerce klinik laboratuvar, antibiyotiklerinin, disklerinin, besiyerlerinin ve cihazlarının doğru performans gösterdiğini doğrulamak için hasta örnekleriyle birlikte ATCC 25922’yi çalıştırır. Beklenen minimum inhibitör konsantrasyonu ve zon çapı aralıkları, tablolarda yayınlanır ve yıllık olarak güncellenir. Laboratuvarın ATCC 25922 için sonuçları bu aralıkların dışında kalırsa, o çalışmadan elde edilen tüm hasta sonuçları geçersiz sayılır.
• Geniş bir antibiyotik yelpazesini test eder: Çoğu ana antibiyotik sınıfına karşı tekrarlanabilir, orta düzeyde duyarlılığa sahiptir. Bu, tamamen duyarlı veya tamamen dirençli suşların gözden kaçırabileceği test performansındaki küçük hataları tespit etmek için idealdir.
• Son derece kararlı ve iyi karakterize edilmiştir: Uygun şekilde muhafaza edildiğinde fenotipik ve genotipik olarak kararlıdır. Tam genom dizilimi yapılmıştır ve kamuya açıktır, biyoenformatik ve moleküler çalışmalarda referans olarak kullanılır. Güvenli (biyogüvenlik seviyesi 1), patojenik olmayan, laktoz fermentasyonu yapabilen, üretimi kolay ve yaygın besiyerlerinde net reaksiyonlar veren bir türdür.
• Mevzuat ve akreditasyon uyumluluğu için gereklidir: Amerikan Patologlar Koleji, ISO 15189 standardı ve birçok ulusal düzenleyici kuruluş gibi akreditasyon kuruluşları için zorunlu bir suştur. Antibiyotik diskleri, otomatik antimikrobiyal duyarlılık test sistemleri ve duyarlılık test cihazlarının ticari üreticileri, ürünlerini ATCC 25922 kullanarak doğrulamalıdır.
• Yeni yöntemler ve araştırmalar için kıyaslama ölçütüdür: Herhangi bir yeni duyarlılık test yöntemi, besiyeri veya antibiyotik, ATCC 25922 sonuçlarına göre doğrulanmalıdır. Antibiyotik direnç mekanizmaları, biyofilm oluşumu, küçük koloni varyantları ve bakteriyel stres tepkileri üzerine araştırmalarda yaygın olarak kullanılır.

Sonuç olarak ATCC 25922 (ve stafilokoklar için ATCC 25923 veya Pseudomonas için ATCC 27853 gibi diğer önemli suşlar) olmadan, modern klinik mikrobiyoloji laboratuvarları bir hastanın enfeksiyonunun antibiyotiklere duyarlı mı yoksa dirençli mi olduğunu güvenilir bir şekilde raporlayamaz. Bu suş, dünya çapında tanısal mikrobiyolojide en sık kullanılan referans suştur.

Kuruluşumuz, yıllardır yetkin ve deneyimli bir kadro ile müşterilerinin ihtiyaçlarını anlamakta, ihtiyaç duydukları ileri test hizmetlerini vermekte ve yönetim sistemlerinin kurulması, uygulanması ve iyileştirilmesi konusunda yardımcı olmaktadır. Bu çerçevede işletmelere “ATCC 25922 Escherichia coli (Migula) Castellani ve Chalmers“ standardına uygun test hizmetleri de verilmektedir.